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1例猪T2T基因组组装、注释及分析

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2026-07-13

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1例猪T2T基因组组装、注释及分析

发布时间：*开通会员可解锁* 16:30:56

截止时间：*开通会员可解锁* 16:40:46

基本信息：

申购主题：1例猪T2T基因组组装、注释及分析

成交总额：*开通会员可解锁*.00 人民币

送货时间：发布竞价结果后3天内送达

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安装要求：免费上门安装（含材料费）

付款方式：货到验收合格后付款

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1例猪T2T基因组组装、注释及分析

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1、T2T基因组常染色体组装利用Nanopore promethION48测序平台完成后的ONT超长reads进行denovo组装。质量要求：基因组无gap，中部着丝粒、亚中部着丝粒、亚端部着丝粒染色体2端端粒完整，着丝粒无缺失且端着丝粒（Chr13、Chr14、Chr15、Chr16、Chr17、Chr18）的染色体组装完整，基因组QV值达到Q45及以上。 2、T2T基因组Y染色体组装利用DNBSEQ-T7平台测序的亲本、子代二代reads和子代Nanopore promethION48平台测序的ONT超长reads进行分型组装。质量要求：Y染色体长度至少40M，Y染色体着丝粒完整，2端端粒完整，Y染色体reads覆盖均匀。 3、基因组注释利用illumina Novaseq平台测序出来的9个二代转录组及9个三代全长转录组和近源种的蛋白进行注释。质量要求：蛋白编码基因数量2万左右，重复序列注释含量46%左右，平均基因长度46k左右。 4、比较基因组分析共线性分析：与近缘物种进行共线性(Collinearity)比较，绘制共线性比较图，解析基因组结构差异(如染色体重排、倒位、易位)。进化与变异分析：进行基因家族聚类、系统发育树构建、物种分化时间推算、基因家族收缩/扩张分析、Ka/Ks偏倚分析。 5、其他其他未尽事项均在合同中约定，并在沟通中适度调整。

1、提供至少2个发表文章达IF>=10的T2T基因组组装案例 2、数据终身保密，数据保存期为1年，保存期到期后及时销毁不得外泄，保存期间提供不限次硬盘拷贝数据服务。 3、分析人员需与客户建立直接联系，定期沟通及反馈分析进度与结果、及时调整分析方法与策略，不得经第三人进行转达沟通。 4、项目需在45个自然日内完成。

数量单位：1.0

单价：*开通会员可解锁*.00(人民币)

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