天津市南开区疾病预防控制中心测序分析项目询价公告

办公室 南开区疾病预防控制中心

我中心拟针对测序分析项目进行供应商遴选，欢迎符合条件的供应商报名参与。

一、项目编号：NK2026005

二、项目内容：测序分析项目

三、项目预算：9.6万

四、调研期限：*开通会员可解锁*至*开通会员可解锁*

五、资质要求

1.供应商须提供有效期内的营业执照复印件；

2.近三年在政府采购招投标活动中，未有违法违规行为。

3.需具备完善的组织机构、健全的财务制度和独立的银行账户。

六、报名要求

根据项目需求递交相关资料，我单位将根据递交的资料对报名供应商进行综合评分，评分最高者确定为该项目成交供应商。项目需求（附件1）及供应商遴选评分标准（附件2）附后。请于1月21日前将相关资料邮寄至天津市南开区红旗南路263号C座，过期邮寄无效。

七、联系方式：

联系单位：天津市南开区疾病预防控制中心

联系人：李瑶

电话：*开通会员可解锁*

全基因组测序加分析：

1.检测内容:基于单菌培养菌液样本进行检测，组装出样本的目的菌株的基因组框架图(fasta文件)；

★2.检测方法:使用二代高通量测序，对样本采用常规文库构建流程，进行深度100X，测序类型PE100以上测序方法，对样本中的核酸进行测序，再通过软件进行De Novo组装，将组装结果进行CARD/VRDB数据库比对，进行耐药、毒力及MLST分析；

3.样本类型:菌株培养悬浊液；

4.检测交付:应在本地完成，样本不得转送天津地区以外；

5.检测周期:具备从收取样本到电子报告发出的时间<14工作日的检测交付能力；

6.投标人需有充足的病原高通量基因检测项目检测经验；

★7,单个样本下机覆盖度≥95%；Q20数据量≥1G base;>1000bp的Scaffold <100；Q30≥85%；

8.投标人提供完善的服务流程、具备完善且合规的样本运输保存流程，提供样本及时转运服务。

宏基因组测序加分析：

1.检测方法:根据宏基因组学方法学原理(metagenomicsNGS,mNGS)，采用常规文库构建流程，利用测序方法:使用二代高通量测序，基于可逆末端终止法边合成边测序技术平台，对样本中的核酸进行测序，分析匹配临床专业数据库，数据库包含约3万种病原菌信息及对应病原菌解释说明；并提供符合致病菌识别网要求的结果格式。

结果包含检测到的所有微生物列表，对应的比对总序列数量、对应的唯一比对序列数量、相对丰度。

2.样本类型:包括但不限于咽拭子、血、脑脊液、肺泡灌洗液痰液、体液、组织等多种样本类型;

3.检测交付: 应在天津本地完成，且实验室应具有生物安全资质，不得转运其他省市；

4.检测周期:具备从收取样本到电子报告发出的时间<14天的检测交付能力;

★5.测序策略：PE150，raw Data>6G；

6.投标人需有充足的病原高通量基因检测项目检测经验:

7.投标人提供完善的服务流程、具备完善且合规的样本运输保存流程，提供样本及时转运服务。

8.报告要求：报告病原体信息原则上准确到种，同时也应包括相应的属信息；报告内容应包括：检测到的所有微生物列表，对应的比对总序列数量、对应的唯一比对序列数量、相对丰度。建议将传染病法中规定需要关注的病原体特殊呈现。同时，报告中还应标明所使用的数据库情况、比对策略说明。

结果判读：样品中单一高序列病原微生物的检出往往代表了其是致病病原体的可能性很高；而多种微生物均可检出，其解读应结合症状及样品类型、传统微生物学检测结果进行综合判断。呼吸道样本中通常会检出多种微生物，需要将所有检出的微生物分类为病原微生物、条件致病性微生物和非致病性微生物，综合每种微生物的测序丰度和患者的临床症状对致病病原体进行判断。致病性明确且罕见定殖的微生物，低序列检出时也应考虑其为病原体的可能性。

加注“★”号条款为实质性条款，不得出现负偏离，发生负偏离即做无效标处理。

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