转录组测序、ATAC测序、靶向三代测序等

相关检测-招标公告

项目概况

转录组测序、ATAC 测序、靶向三代测序等相关检测的潜在投标

人应在中国通用招标网（http://www.china-tender.com.cn）获取招

标文件，并于 2026 年 7 月 6 日 9 时 30 分整（北京时间）前递交投标

文件。

一、项目基本情况

1.招标编号/包号：*开通会员可解锁*0180/01

3.项目名称：转录组测序、ATAC 测序、靶向三代测序等相关检测

4.项目预算金额：20.5 万元、项目最高限价（如有）

： / 万元

5.采购需求：

包号

标的名称

数量

采购包预算

金额（万元）

简要技术需求

或服务要求

1

转录组测序、ATAC 测序、

靶向三代测序等相关检测

1 项

20.5

详见第五章《采

购需求》

6.合同履行期限：详见第五章《采购需求》

。

7.本项目是否接受联合体投标：□是 ■否。

二、申请人的资格要求（须同时满足）

1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定；

2.落实政府采购政策需满足的资格要求：

2.1 中小企业政策

■本项目不专门面向中小企业预留采购份额。

□本项目专门面向 □中小 □小微企业 采购。即：提供的货物全部由符

合政策要求的中小/小微企业制造、服务全部由符合政策要求的中小/小微企业承

接。

□本项目预留部分采购项目预算专门面向中小企业采购。对于预留份额，提

供的货物由符合政策要求的中小企业制造、服务由符合政策要求的中小企业承接。

预留份额通过以下措施进行： / 。

2.2 其它落实政府采购政策的资格要求（如有）

： / 。

3.本项目的特定资格要求：

3.1 本项目是否属于政府购买服务：

■否

□是，公益一类事业单位、使用事业编制且由财政拨款保障的群团组

织，不得作为承接主体；

3.2 其他特定资格要求：/。

三、获取招标文件

1.时间：2026 年 6 月 12 日至 2026 年 6 月 22 日，每天上午 9:00 至 11:30，

下午 13:30 至 17:00（北京时间，法定节假日除外）

。

2.地点：中国通用招标网（http://www.china-tender.com.cn）

3.方式：投标人应先在中国通用招标网（http://www.china-tender.com.cn）

进行免费注册，注册完成后请按照网上操作流程进行报名下载文件。

1）有意向的投标人应先在中国通用招标网

（http://www.china-tender.com.cn）进行免费注册，中国通用招标网注册审核

电话：400-680-8126。

2）注册完成后，按网上操作流程支付平台信息技术支持服务费，服务费为：

500 元/包。平台自动开具电子普通发票。

3）如遇平台问题，请联系中国通用招标网技术支持：400-680-8126 转 2。

4.售价：0 元。

四、提交投标文件截止时间、开标时间和地点

投标截止时间、开标时间：2026 年 7 月 6 日 9 点 30 分（北京时间）

。

地点：北京市丰台区西三环南路 14 号院首科大厦 A 座 4 层 405 号中技国际

招标有限公司会议中心。

五、公告期限

自本公告发布之日起 5 个工作日。

六、其他补充事宜

1.本项目需要落实的政府采购政策：鼓励节能、环保政策：

（1） 依据《财政部发展改革委生态环境部市场监管总局关于调整优化节能

产品、环境标志产品政府采购执行机制的通知（财库（2019）9 号）》

执行。

（2） 扶持中小企业政策：本项目评审时小型和微型企业产品享受 10%的价

格折扣。监狱企业视同小型、微型企业。残疾人福利性单位视同小型、

微型企业。不重复享受政策。

（3） 支持本国产品政策：根据国务院办公厅关于在政府采购中实施本国产

品标准及相关政策的通知（国办发〔2025〕34 号）要求，政府采购活

动中既有本国产品又有非本国产品参与竞争的，依法对本国产品给予

价格评审优惠，对本国产品的报价给予 20%的价格扣除，用扣除后的

价格参与评审。具体落实情况详见招标文件。（本项目不适用）

（4） 本项目采购标的接受进口产品情况：本项目是否接受进口产品见第五

章《采购需求》。

2.申请人的资格要求补充：

（1） 被“信用中国”网站（www.creditchina.gov.cn）列入失信被执行人和

重 大 税 收 违 法 案 件 当 事 人 名 单 的 、 被 “ 中 国 政 府 采 购 网 ” 网 站

（www.ccgp.gov.cn）列入政府采购严重违法失信行为记录名单（处罚

期限尚未届满的）的供应商，不得参与本项目的政府采购活动。

（2） 单位负责人为同一人或者存在直接控股、管理关系的不同供应商，不得

参加同一包的投标或者未划分包的同一招标项目的投标。

1)本条所指单位负责人为同一人指单位法定代表人或者法律、行政法

规规定代表单位行使职权的主要负责人。

2)本条所指控股关系指单位或股东的控股关系。控股股东指:

a.出资额占有限责任公司资本总额百分之五十以上或者其持有的股份

占股份有限公司股本总额百分之五十以上的股东；

b.出资额或者持有股份的比例不足百分之五十，但其出资额或者持有

的股份所享有的表决权已足以对股东会、股东大会的决议产生重大影

响的股东。

3)本条所指管理关系指不具有出资持股关系的其他单位之间存在的管

理与被管理关系。

注：本条所指的控股、管理关系仅限于直接控股、直接管理关系，不

包括间接控股或管理关系。

（3） 为本采购项目提供过整体设计、规范编制或者项目管理、监理、检测等

服务的供应商及其附属机构，不得再参加本采购项目的投标活动。

（4） 按照招标公告要求购买了招标文件。

（5） 符合法律、行政法规规定的其他要求。

3.本项目资金情况：财政性资金，资金已落实。

七、对本次招标提出询问，请按以下方式联系。

1.采购人信息

名 称：首都儿科研究所

地 址：北京市朝阳区雅宝路 2 号

联系方式：*开通会员可解锁*

2.采购代理机构信息

名 称：中技国际招标有限公司

地 址：北京市丰台区西营街 1 号院通用时代中心 C 座 9 层

联系方式：*开通会员可解锁*

3.项目联系方式

项目联系人：强文晓、孙薇

电 话：*开通会员可解锁*

第五章 采购需求

一、采购标的需实现的功能或者目标，以及为落实政府采购政策需满足的要求

(一)采购标的需实现的功能或者目标：

本次招标采购是为首都儿科研究所购置转录组测序、ATAC测序、靶向三代测

序等相关检测，投标人应根据招标文件所提出的技术规格和服务要求，综合考虑

设备的适用性，选择需要最佳性能价格比的设备前来投标。投标人应以技术先进

的设备、优良的服务和优惠的价格，充分显示自己的竞争实力。

（二）为落实政府采购政策需满足的要求

1. 促进中小企业发展政策：根据《政府采购促进中小企业发展管理办法》规定，

本项目采购服务由小型或微型企业承接的，投标人应出具招标文件要求的

《中小企业声明函》给予证明，否则评标时不予认可。投标人应对提交的中

小企业声明函的真实性负责，提交的中小企业声明函不真实的，应承担相应

的法律责任。（注：依据《政府采购促进中小企业发展管理办法》规定享受

扶持政策获得政府采购合同的小微企业不得将合同分包给大中型企业，中型

企业不得将合同分包给大型企业。

）

2. 监狱企业扶持政策：投标人如为监狱企业将视同为小型或微型企业，且所投

产品为小型或微型企业生产的，应提供由省级以上监狱管理局、戒毒管理局

（含新疆生产建设兵团）出具的属于监狱企业的证明文件。投标人应对提交

的属于监狱企业的证明文件的真实性负责，提交的监狱企业的证明文件不真

实的，应承担相应的法律责任。

3. 促进残疾人就业政府采购政策：根据《三部门联合发布关于促进残疾人就业

政府采购政策的通知》

（财库〔2017〕141 号）规定，符合条件的残疾人福利

性单位在参加本项目政府采购活动时，投标人应出具招标文件要求的《残疾

人福利性单位声明函》，并对声明的真实性承担法律责任。中标、成交投标

人为残疾人福利性单位的，采购代理机构将随中标结果同时公告其《残疾人

福利性单位声明函》，接受社会监督。残疾人福利性单位视同小型、微型企

业。不重复享受政策。

4. 鼓励节能政策：投标人的投标产品属于财政部、发展改革委公布的“节能产

品政府采购品目清单”范围的，投标人需提供国家确定的认证机构出具的、

处于有效期之内的节能产品认证证书。国家确定的认证机构和节能产品获证

产品信息可从市场监管总局组建的节能产品、环境标志产品认证结果信息发

布平台或中国政府采购网（www.ccgp.gov.cn）建立的认证结果信息发布平

台链接中查询下载。

5. 鼓励环保政策：投标人的投标产品属于财政部、生态环境部公布的“环境标

志产品政府采购品目清单”范围的，投标人需提供国家确定的认证机构出具

的、处于有效期之内的环境标志产品认证证书。国家确定的认证机构和环境

标志产品获证产品信息可从市场监管总局组建的节能产品、环境标志产品认

证结果信息发布平台或中国政府采购网（www.ccgp.gov.cn）建立的认证结

果信息发布平台链接中查询下载。

二、采购标的需执行的国家相关标准、行业标准、地方标准或者其他标准、规

范

符合已颁布的现行中华人民共和国认可的国家标准、地方标准和行业标准。

如果这些标准内容有矛盾时，应按最高标准的条款执行。

三、采购标的的数量、采购项目交付或者实施的时间和地点

（一）采购标的的数量

包号

标的名称

数量 是否接受进口产品

1

转录组测序、ATAC 测序、靶向三代测序

等相关检测

1 项

否

具体明细：

序号

检测项目

单位

数量

单价限价（元）

1

转录组测序

次

20

1000

2

ATAC 测序

次

10

3500

3

靶向三代测序

次

15

3000

4

全转录组测序

次

20

2250

5

ChIP-seq

例

10

1000

6

CUT&Taq

例

10

5000

注：投标人所投检测项目单价均不能超过上表中规定的单价限价，否则按废标处

理。

（二）采购项目交付或者实施的时间和地点：

1、采购项目（标的）交付的时间（服务期限）

：测序及数据分析 20 个工作日内

交付全部结果。

2、采购项目（标的）交付的地点（服务地点）：采购人指定地点。

三、采购标的需满足的服务标准、期限、效率等要求

（一）采购标的需满足的服务标准、效率要求（以各包技术规格中要求为准，

如技术规格中无要求，则以本款要求为准。）

详见七、采购招标的需满足的质量、安全、技术规格、物理特性等要求。

（二）采购标的需满足的服务期限要求

1.服务期限：数据验收合格之日起，提供原始数据保存及数据维护服务。

1.1 数据保存期限：原始数据存储时间为 12 个月或以上，采用移动硬盘或云盘

进行数据传输，具体存储时限可以根据用户要求缩短或延长。数据上传，可以提

供上传步骤及文件，对测试结果负有保密义务。

1.2 样本保存期限：

投标人承诺在项目结题或中止后，

继续免费保存样本 6 个月。

样本保存期间，投标人严格按照实验室管理规范进行样本存储管理。

五、采购标的物验收标准

投标人将结题报告通过邮件发送至合同基本信息中确定的采购人项目联系

人的电子邮箱或者通过上传至相应的平台并将相应的账号密码告知采购人项目

联系人，采购人在收到结题报告或者下载结题报告后按照合同约定进行项目的验

收。提供验收相关材料，并保证材料的真实性。

六、采购标的的其他技术、服务等要求

投标人需按照招标文件要求严格遵循质量管理体系，建立样本接收、核酸提

取、文库构建、上机测序、数据分析、结果交付全流程标准化质控体系，提供「样

本接收-前处理-建库测序-生信分析-报告交付-技术答疑」全链条一站式测序检

测服务，专属专项服务团队，30 分钟内响应客户售后，24h 小时提供解决方案。

七、采购标的需满足的质量、安全、技术规格、物理特性等要求：

第 1 包 转录组测序、ATAC 测序、靶向三代测序等相关检测

一、商务要求

1、实验结果提交期：测序及数据分析 20 个工作日内交付全部结果。

2、交付内容：交付的数据应当包含测序的原始 FAST 文件（需硬盘拷贝交付），

按照约定方案的分析结果（包含图、表以及其他格式的序列文件），以及根据项

目进行产生的新的分析结果。

3、验收标准：投标人将结题报告通过邮件发送至合同基本信息中确定的采购人

项目联系人的电子邮箱或者通过上传至相应的平台并将相应的账号密码告知采

购人项目联系人，采购人在收到结题报告或者下载结题报告后按照合同约定进行

项目的验收。提供验收相关材料，并保证材料的真实性。

二、质保期售后服务：

1、数据验收合格之日起，提供原始数据保存及数据维护服务。

2、数据保存期限：原始数据存储时间≥12 个月，采用移动硬盘或云盘进行数据

传输，具体存储时限可以根据用户要求缩短或延长。数据上传：可以提供上传步

骤及文件，对测试结果负有保密义务。

3、样本保存期限：投标人承诺在项目结题或中止后，继续免费保存样本≥6 个

月。样本保存期间，投标人严格按照实验室管理规范进行样本存储管理。

4、有专业的售后服务团队提供长期的售后支持服务。项目结题后，如采购人在

报告解读和数据挖掘中有任何疑问和需要协助解决的问题，投标人在接到采购人

电话或邮件请求后，及时提供相应帮助和解答。

三、检测要求：

（一）

、检测平台实力要求：服务团队可提供多组学测序方案，对本项目的检测

服务由投标人完成，并保证项目执行过程中与平台相匹配的试剂储备。样本抽提、

建库、测序、分析都有相应的质控检测，保障数据质量。

（二）

、检测项目要求

1、转录组测序

1.1、样本运输：细胞样本每离心管 1×10

6 个细胞，用 parafilm 膜密封，-80℃

保存，干冰运输。

1.2、质控：

1.2.1、RNA 抽提质检：

1.2.1.1、样品量：Qubit3.0 检测浓度≥100ng/μL；总量≥2μg。

1.2.1.2、样品纯度（Nanodrop 检测）

：OD260/280，1.8～2.2 之间；OD260/230

≥2.0。

1.2.1.3、样品完整度：Agilent 2100 Bioanalyzer 检测 RIN 值 ≥ 7.0，且

28S/18S≥1.0；完整无基因组 DNA 污染的 Total RNA。

1.2.2、文库质检：

1.2.2.1、Qubit3.0 浓度：5～100ng/μL

1.2.2.2、Agilent 2100 Bioanalyzer 条带范围：200-500bp，主峰：300bp±10

bp。

▢1.2.3、数据质控：Illumina 2×150bp 测序，转录组数据量≥10G，Q30≥80%，

rRNA 比例≤rawdata 的 5%。

1.3、数据分析

1.3.1、mRNA 标准分析：包括原始测序数据预处理、数据质量过滤；参考序列比

对分析（比对数据库：人 hg38）

；

1.3.2、mRNA 表达定量（基因注释数据库:人：GENCODE）包括；

1.3.2.1、mRNA 表达定量。

1.3.2.2、mRNA 差异表达分析：提供分组信息、生物学重复。

1.3.2.3、差异基因 GO 和 KEGG 富集分析。

1.3.2.4、差异基因 GSEA 富集分析。

1.3.2.5、可变剪切分析（高级分析）

。

1.3.2.6、新转录本预测（高级分析）

。

1.3.2.7、融合基因分析（高级分析）

。

1.3.2.8、差异基因蛋白互作网络分析-。

1.2.2.9、WGCNA 分析：样本个数≥15 个。

1.3.3、lncRNA 标准分析（基因注释数据库:人：GENCODE）包括：

1.3.3.1、原始测序数据预处理。

1.3.3.2、数据质量过滤。

1.3.3.3、参考序列比对分析。

1.3.3.4、鉴定已知 lncRNA。

1.3.3.5、lncRNA 表达定量。

1.3.3.6、lncRNA 差异表达分析。

1.3.3.7、差异 lncRNA 靶基因预测。

1.3.3.8、差异 lncRNA 靶基因的 GO 和 KEGG 富集分析。

1.3.3.9、新 lncRNA 预测；

1.3.4、circRNA 分析包括：

1.3.4.1、circRNA 识别分析。

1.3.4.2、circRNA 表达定量。

1.3.4.3、circRNA 差异表达分析。

1.3.4.4、差异 circRNA 来源基因的 GO 和 KEGG 富集分析。

1.3.4.5、差异 circRNA 的靶标 miRNA 预测。

1.3.5、联合分析 A 包括：相互作用/调控关系网络分析、差异 lncRNA 与差异 mRNA

相互作用。

1.3.6、其他分析辅助内容：包括已有分析内容中的图表制作分析（散点图、直

方图、文氏图、PCA 图、聚类分析图、热图等。

1.4、投标人应提供实验操作步骤、数据分析流程、方法原理。提供数据包括：

原始测序数据(fastq 格式)、经 mapping，alignment 等处理后得到的（fast，

vcf 格式）和标准格式数据、上述生物信息学分析数据等。

2、ATAC 测序

2.1、细胞样本质控；

2.1.1、样品量：制成单细胞悬液后总细胞数量≥1×10

5。

2.1.2、样本纯度/完整度：样本活细胞比例≥70%，无外源污染，样本活率不足

时可能按需进行“基于磁珠的死细胞去除处理”

。

2.2、建库、测序技术性能指标

2.2.1、利用转座酶进行 ATAC-seq 文库构建，在 10 个工作日内出具质控报告。

▢ 2.2.2 、 提 供 Illumina 2 × 150bp 测 序数 据 ， 通 过 质 控 样 本， 数 据 量 ≥

15Grawdata/样本，Q30≥80%。

2.3、数据分析包括：

2.3.1、原始数据整理、过滤及质量评估。

2.3.2、参考基因组注释信息整理。

2.3.3、比对到参考基因组及结果评估。

2.3.4、Peak Calling。

2.3.5、Peak motif 分析。

2.3.6、差异 Peak 分析：差异 Peak 注释与筛选、差异 Peak 可视化显示、差异

Peak 相关基因 GO 富集分析、差异 Peak 相关基因 KEGG 富集分析。

3、靶向三代测序

3.1、样本质控：

3.1.1、样品澄清透明，总量≥3μg，浓度≥100ng/μL。

3.1.2、

Nc/Qc：

0.9～1.5 之间；

DNA 纯度 OD260/280：

1.8～2.0 之间；

OD260/OD230：

2.0～2.2 之间。

3.1.3、DNA 浓度≥50 ng/μL；DNA 完整无降解，无 RNA、蛋白质等污染，片段

平均长度≥10kb。干冰运输。

3.2、建库、测序：样本初步质控→DNA 提取→选择对应建库试剂盒→文库质检

→加载至芯片→实时测序→Basecalling 生成 fastq→下游分析。

3.3、数据分析：

3.3.1、测序数据质控：比对和过滤、SNV/indel calling 及注释。

3.3.2、SV calling 及注释 、关联 Clinvar/OMIM/gnomAD 数据库。

3.3.3、根据人群频率（gnomAD 所有人群频率<1%）筛选变异、根据 SV 重复、缺

失、倒位、重排等变异类型筛选 。

3.3.4、根据 ACMG 指南，筛选评级为 Pathogenic/Likely pathogenic/Uncertain

Significance 的 SNV/indel/SV 变异。

3.4、出具检测结果：

3.4.1、提供有独立算法的遗传病数据分析+解读分析系统，用于采购人临床数据

的平行分析及确认；具备持续更新的群体变异频谱库与进行过临床预解读和注释

的变异位点库，保障分析结论具有群体代表性和覆盖范围的完备性。

3.4.2、遗传解读能力：遗传解读参考的专业数据库包括 HGMD（专业版）

、ClinVar、

Varsome，并有能力准确应用 ACMG 变异评级框架及每年定期更新的 ClinGen 的基

因或疾病专门性指南，来对各种 SNV、indel、SV 及 CNV 变异进行最新评级，并

具备基因-疾病关联性评估能力。

4、全转录组测序

4.1、样本质控：

4.1.1、由乙方提取 RNA，并进行 RNA 质量检测。

4.1.2、lncRNA 建库核酸质检标准：总量≥400ng，RIN 值≥6。

4.1.3、smallRNA 建库核酸质检标准：建库核酸量≥1000ng，RIN 值≥7.5。

4.2、建库、测序技术性能指标

4.2.1、每例合格样本分别构建 lncRNA 和小 RNA 两个测序文库并测序。

4.2.2、建库方式和数据合格标准：

4.2.2.1、lncRNA 文库，通过去除去核糖体 RNA 方式构建链特异性文库，原始数

据产出 Raw Data≥12G base。

4.2.2.2、小 RNA 文库，采取切胶选取小 RNA 片段的方式进行建库和测序，原始

数据产出≥10M reads。

4.2.3、原始数据质控标准：Q20≥85%，Q30≥80%。

4.3、数据分析

4.3.1、small RNA 分析内容包含：质量控制、数据产出统计及测序数据的成分

和质量评估、长度分布统计、参考序列比对分析、miRNA 表达量统计、样品间 miRNA

表达水平的相关性分析、miRNA 差异表达分析和聚类分析、miRNA 靶基因预测、

差异表达 miRNA 靶基因功能富集分析等步骤。

4.3.2、lncRNA 分析内容包括：质量控制、数据产出统计及测序数据的成分和质

量评估、参考序列比对分析、序列拼接组装、候选 lncRNA 筛选、鉴定已知 lncRNA

和注释具有编码潜能的新转录本、表达水平分析、样本间表达水平的相关性分析、

co-location 作用靶基因预测、差异表达水平分析、GO 富集分析、KEGG 富集分

析。

4.3.3、circRNA 分析内容包括质量控制、数据产出统计及测序数据的成分和质

量评估、参考序列比对分析、定量分析、circRNA 差异表达和聚类分析、差异

circRNA 来源基因 GO 富集和 KEGG 富集。

4.3.4、关联分析：通过 miRNA 的靶向关系来获取候选的 ceRNA 关系对，以显著

上调或下调的 mRNA 为中心进行靶向关系联合分析，基于 ceRNA 网络进行差异

lncRNA-miRNA-mRNA 关系对分析，系统化地解释复杂调控机制。

5、ChIP-seq

5.1、质量检测(Qubit+Agilent 2100)：要求 DNA 片段分布在 100-500bp 的比例

≥50%，主峰分布在 200～300bp 之间。

5.2、建库、测序技术性能指标：

5.2.1、文库构建：每个样本包括 ChIP 富集和 Input 对照两类文库，采用低起

始量 DNA 建库试剂盒构建文库。

▢5.2.2、Illumina2×150bp 测序数据，通过质控样本，数据量≥6Grawdata/文

库(Input 和 ChIP 文库分别计)，Q30≥80%。

5.3、数据分析包括：

5.3.1、原始数据质控：生成碱基错误率分布图、生成碱基质量分布图、生成碱

基组成分布图。

5.3.2、原始数据预处理及整理：对原始数据进行过滤，得到 clean reads 用于

后续分析；统计过滤前后的数据量。

5.3.3、参考序列比对分析：clean reads 和参照序列比对、统计 mapping 率、

统计比对序列在参考基因组上的分布。

5.3.4、Peak 分析

5.3.4.1、MACS 软件识别 peak 区域。

5.3.4.2、差异 peak 分析；生成差异 peak 分析结果、差异 peak 基因注释、差异

peak 筛选、差异 peak 聚类热图、差异 peak 可视化显示。

5.3.4.3、富集分析：差异 peak 的 GO 富集分析、差异 peak 的 GO 富集柱形

图、差异 peak 的 GO 有向无环图、差异 peak 的 KEGG 富集分析、差异 peak 的

KEGG 富集散点图、差异 peak 富集的 KEGG 通路图、差异 peak 的 KEGG 富集

热图。

6、CUT&Tag

6.1、样本质控：

6.1.1、样品量：制成单细胞悬液后总细胞数量≥2×10

5；如目标蛋白为转录因

子，要求总细胞数≥4×10

5。

6.1.2、样本纯度/完整度：样本活细胞比例≥70%，无外源污染，样本活率不足

时可能按需进行“基于磁珠的死细胞去除处理”

。

6.2、建库、测序：

6.2.1、进行 CUT&Tag 文库构建，在 10 个工作日内出具质控报告。

▢6.2.2、Illumina 2×150bp 测序数据，通过质控样本，数据量≥20M reads/

样本，Q30≥80%。

6.3、数据分析包括：

6.3.1、原始数据整理、过滤及质量评估。

6.3.2、参考基因组注释信息整理。

6.3.3、比对到参考基因组及结果评估。

6.3.4、Peak Calling。

6.3.5、Peak motif 分析。

6.3.6、差异 Peak 分析：差异 Peak 注释与筛选、差异 Peak 可视化显示、差异

Peak 相关基因 GO 富集分析、差异 Peak 相关基因 KEGG 富集分析。